HLAのクラスⅠ（A，B，C）を遺伝子レベルで詳細に型判別できる検査である。移植臓器の適合性判定にきわめて有用である。

　HLAは、ヒト主要組織的合抗原と呼ばれる糖タンパクで、マウスにおけるH-2抗原に相当する。ヒトでは、HLA-A，B，C抗原などからなるクラスⅠ抗原と、HLA-DR，DQ抗原などからなるクラスⅡ抗原に大別される。前者はほとんどの有核細胞、血小板上に表現され、後者はB細胞、単球、活性化T細胞など限られた細胞上に発現されている。これらはHLAの遺伝子による一連の遺伝子群の支配を受け、その領域は第6染色体短腕上に存在する。

　ヒトの主要組織適合複合体（MHC）であるHLA抗原のタイピングは、これまで主に血清学的ならびに細胞学的検査法にて行われてきた（HLA-A，B Locusの項を参照）が、現在ではHLAの遺伝子をターゲットとした、より細かく正確なDNAタイピングが可能となり、その有用性が確立されている。

　HLAクラスⅠDNAタイピングは、従来法で同定困難なタイプの検出や、ホモ型の鑑別、あるいはHLAクラスⅡ遺伝子のタイピングと併せて、より詳細かつ確実なHLA適合性の判定に寄与する。

　具体的な応用例としては、HLAクラスⅠ抗原のアリル（allele：対立遺伝子）レベルでのマッチングが、非血縁者間での骨髄移植や腎移植の予後（GVHD発症率、1年生存率）に密接に関連することが報告されている。

　なお、対象となる遺伝子は多岐にわたるため、検査の依頼に際しては、A，B，Cの3つのLocusのいずれかの指定が必要である。